双方明确，将从布局建设战略科技力量、开展医学核心技术攻关、推动大健康创新链产业链深度融合、引育医学创新人才和团队、推进科技开放合作、营造成果转化创新生态等六个方面深度协同、共同实施。
具体内容包括，双方将共同争创全国重点实验室、国家技术创新中心、国家临床医学研究中心、国家医学中心等国家级平台；支持优势单位联合申报国家科技重大专项和重点研发计划专项项目，联合设立“重庆市科卫联合基金”，组织实施科卫联合科研项目(含中医)；推动建设金凤国际医学中心，打造高水平专科医疗产业集群、高质量医学教育基地、重庆医工融合发展中心；探索建立人才联合培养机制；加强与国内高水平医疗卫生机构、优势生物医药企业合作，共同推进技术攻关、技术转移、示范服务平台建设；支持开展赋予科研人员职务科技成果所有权或长期使用权改革和单列管理改革等。
据悉，自2018年10月两部门签署《科卫协同合作协议》以来，双方合作取得了丰硕成果，推动科技创新、健康中国战略在渝布局态势良好，国家卫生健康委与科技部合作协议在重庆落地实施有力有效，重庆卫生健康事业创新发展成效明显。
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